鸡粪在发酵后有很大的用途，可以作为鱼虾的饲料或者作为栽植花卉和种植的肥料使用，过去养鸡产生的鸡粪基本都是堆放半年让其自然发酵，在这其间不但臭味熏天，还有很多养分也流失了。现在用微生物发酵，发酵时间短而且鸡粪的营养也很少流失。

微生物发酵时是给鸡粪中加入鸡粪发酵剂菌种进行发酵，一般是按1000公斤的干鸡粪加入2公斤的鸡粪发酵剂菌种，也可用700公斤的湿鸡粪加上300公斤的秸干或者是稻糠，再加2公斤的鸡粪发酵剂菌种进行发酵。

微生物发酵时要先准备一个不渗水的池子或大容器，把新鲜的干鸡粪倒入池子或大容器中，用铁锹搅拌，使其细碎留着备用。

把鸡粪发酵剂菌种用井水或者是河水稀释，一般是2公斤的鸡粪发酵齐菌种加入600公斤的水进行搅拌稀释，也可根据鸡粪的干湿程度加水稀释，鸡粪干的话，多加点水，鸡粪湿的话，少加点水。

将稀释好的鸡粪发酵剂菌种倒入装有干鸡粪的池子或容器中，用铁锹搅拌使鸡粪和鸡粪发酵剂菌种完全混合均匀，搅拌好的鸡粪和鸡粪发酵剂菌种混合物干湿程度要以用手可以捏成团感觉有水但没有水滴下来为好，不能太湿，太湿了容易发酸，也不能太干，太干了就不能完全发酵。

这些工作都做完后，把鸡粪和鸡粪发酵剂菌种混合物在池子或容器中压实，排出混合物中的空气，再用塑料膜封闭，池子或容器中不能存有空气，春天和秋天7天就可以发酵好了，夏天时间短点，5天就可以，冬天时间要长一点，需要10天左右，一般是没有臭味即为发酵好了。