商品有机肥和粪肥同样能够补充有机质，促进团粒结构的形成。但从绿色健康可持续发展方面来讲，商品有机肥更有优势。这是因为商品有机肥与粪肥有很多不同之处。

 

　　首先，商品有机肥比粪肥“无害”。

 

　　两种肥料的区别重点在于“腐熟”和“无害”。与商品有机肥相比，粪肥存在许多缺陷：

 

　　粪肥

 

　　一是含盐分较多，容易使土壤盐化。

 

　　二是粪肥带有大量的病菌、虫卵，最易引发棚室内的病虫害；

 

　　三是粪肥养分含量不稳定，不能做到合理补肥。

 

　　四是粪肥内若含有害物质、重金属物质时，仅凭借高温发酵不能去除。

 

　　畜禽粪便对土壤既有有利的一面，也有不利的一面，两个方面在一定条件下能够相互转化。畜禽粪便的有利一面在于：能够作为肥料施用于农田培肥土壤;经常施用粪肥也能提高土壤抗风化和水侵蚀的能力，改变土壤的通气和耕作条件，增加土壤有机质和有益微生物的生长。

 

　　不利的方面在于：过度使用未经无害化处理的粪便会危害农作物、土壤、地表水和地下水水质。在某些情况下(通常是新鲜粪便)有烧苗现象;大量使用粪便也能引起土壤中溶解盐的积累，使土壤盐分增高，植物生长受影响。据报道，1999年在非洲有31%的牧场因畜禽粪便污染导致土壤发生盐渍化，土壤肥力下降。

 

　　其次，商品有机肥改良土壤效果更迅速

 

　　若是土壤出现了不良状况，使用商品有机肥改良比粪肥更加快速。

 

　　这是因为商品有机肥具有洁净性和完熟性两大特点。商品有机肥在制作过程中不仅进行高温杀菌杀虫，通过微生物完全发酵，并且很好地控制氧气和发酵温度，使有机物质充分分解成为直接形成团粒结构的腐殖质等，同时产生的氨基酸和有益代谢产物得以保留。使用后不会产生对蔬菜有影响的物质。

 

　　再次，商品有机肥的养分配比更合理

 

　　商品有机肥中的各类养分是可调整的，可以针对不同的土壤状况使用不同养分含量的产品。